新闻资讯

T.E.S.T软件介绍

发布时间:2025-07-25 14:37:43 浏览次数:252 次

返回

目前,我们的日常生活中接触到的工业化学物质大约超过100,000种,其中一些可能对人体健康产生不利影响。

化学物质的安全性通常通过动物试验、细胞试验、微生物试验等生物检测来评估。然而,在考虑时间、劳动力、物质成本和动物伦理等多种因素时,以这种方式测试如此大量的化学物质是不现实的。



定量构效关系(QSAR)


为了实现可持续发展目标,需要一种能够迅速准确识别有害化学物质的有效筛选工具。

定量构效关系(Quantitative Structure Activity Relationships,QSAR)是一种计算机模拟方法,它主要基于各种分子描述符和模型算法,建立化合物的结构与其理化性质,生物学活性,毒理学效应,环境行为和归趋等的定性/定量关系,即根据目标物质的化学结构特征预测其生理效应或理化性质等,具有快速高效的特点,能够有效节约测试成本。

QSAR是目前国内外一个活跃的研究领域,美国环境保护署(United States Environmental Protection Agency,简称US EPA)就基于QSAR开发了针对化学物质毒性预测的软件——Toxicity Estimation Software Tool (T.E.S.T)。

T.E.S.T

T.E.S.T软件可根据大量的数据处理和统计识别目标化合物中潜在的有毒基团,还能快速地分析与目标物质结构相似的化合物的毒性,进一步综合预测目标物质的毒性。

T.E.S.T界面简洁,操作简单,并且软件内配有指南,易上手,用户可通过CAS号、SMILES码、物质名称、InChi码、DTXSID或是手动绘制载入化学物质结构,然后选定预测终点与方法,更改结果输出路径后即可进行预测,软件预测完毕会自动生成结果报告。

170556339358554991.png

T.E.S.T软件用户界面与基本操作流程

T.E.S.T的预测终点包括毒性和理化性质两大类别。

◇ 毒性预测终点:

预测终点

介绍

LC50(Fathead minnow 96-hr)

96小时导致50%黑头呆鱼(Fathead minnow)死亡的水中试验化学物质浓度(mg/L)。

LC50(D. magna 48-hr)

48小时导致50%大型蚤(Daphnia magna)死亡的水中试验化学物质浓度(mg/L)。

LC50(T. pyriformis 48-hr)

48小时对50%梨形四膜虫(Tetrahymena pyriformis)生长产生抑制作用的水中试验化学物质浓度(mg/L)。

LC50(Oral rat)

导致50%的大鼠口服后死亡的化学物质量 (mg/kg bw)。

生物富集因子

(Bioaccumulation factor)

达到平衡状态时,化合物在生物体内浓度与环境介质中浓度的比值。

发育毒性

(Developmental toxicity)

化学物质是否会对人类或动物产生发育毒性效应。

鼠伤寒沙门氏杆菌回复突变试验

(Ames mutagenicity)

如果化学物质在鼠伤寒沙门菌菌株(Salmonella typhimurium)中诱导回复突变菌落生长,则该化合物为致突变物。


◇ 理化性质预测终点:

预测终点

介绍

标准沸点

(Normal boiling poin)

化学物质在标准大气压(1个大气压)下沸腾的温度(℃)

蒸汽压

(Vapor pressure)

在25℃的密闭条件中,与固体或液体处于相平衡的蒸气所具有的压强(mmHg)。

熔点

(Melting point)

化学物质从固体变为液体的温度(℃)。

闪点

(Flash point)

化学物质与外界空气形成混合气与火焰接触时发生闪火并立刻燃烧的最低温度

密度

(Density)

单位体积质量(g/cm3)

表面张力

(Surface tension)

液体表面层由于分子引力不均衡而产生的沿表面作用于任一界线上的张力(dyn/cm)。

热导率

(Thermal conductivity)

物质传导热量能力的量度值 (mW/mK)。

黏度

(Viscosity)

流体对流动所表现的阻力(cP)

水溶性

(Water solubility)

化学物质溶于液态水中形成均相溶液的浓度(mg/L)。

预测方法:

T.E.S.T内包含了Chi连接指数、Kappa形状指数、2D结构特征等14类,共计797个描述符。

同时,T.E.S.T的预测方法有5种,即层次聚类法、单一模型法、基团贡献计算法、最近邻法、一致性评价方法。用户可依据自身需求选择和合适的预测方法来增加预测结果的可信度。


方法

介绍

层次聚类法

(Hierarchical method)

使用来自几种不同聚类模型的预测加权平均值来预测化学物质的毒性。

单一模型法

(Single model method)

使用适合训练集的多元线性回归模型进行预测(使用分子描述符作为独立变量)。

基团贡献计算法

(Group contribution method)

使用适合训练集的多元线性回归模型进行预测(使用分子片段计数作为独立变量)。

最近邻法

(Nearest neighbor method)

通过取训练集中与测试化学物质最相似的3种化学物质的平均值来预测目标化学物质的毒性。

一致性评价方法

(Consensus method)

通过取上述QSAR方法预测毒性的平均值来预测化学物质的毒性(预测结果在各自方法的适用范围内)。

◇ 模型拟合度:

用户在进行QSAR预测时往往最关心的是预测结果的准确性。T.E.S.T.指南文件指出,如果QSAR模型满足以下条件,则认为该模型具有可接受的预测能力:

屏幕截图 2024-01-18 150252.png

R²是真实值与预测值之间的相关系数(即为不过原点回归时相关系数的平方),R0²是回归曲线截距为零时真实值和预测值之间的相关系数(即为过原点回归时相关系数的平方),k是回归曲线截距为零时的回归方程系数。公式(1)(2)都是对线性回归模型的拟合度量,满足(1)(2)公式条件,即说明模型拟合度较好,具有良好的预测能力。


指南文件介绍了软件中各个QSAR模型的统计参数,本文以LC50(fathead minnow 96-hr)毒性终点和标准沸点(Normal boiling point)的测试集结果为例介绍T.E.S.T中的模型性能。

LC50(fathead minnow 96-hr)测试集结果:

屏幕截图 2024-01-18 150415.png

图片3.png

LC50(fathead minnow 96-hr)测试集结果显示,五种方法的R²均满足公式(1)的条件,且一致性评价方法的结果最好。单一模型法、基团贡献计算法、一致性评价方法不满足公式(2)的条件。


依据T. E. S. T.指南指出不满足这些条件的模型本身并非绝对无效的,其预测结果是相对保守的,应该谨慎使用。


◇ 标准沸点(Normal boiling poin)测试集结果:

屏幕截图 2024-01-18 150841.png

屏幕截图 2024-01-18 150925.png

单一模型法不适用于标准沸点的预测,因此没有其测试集结果,其余四种方法的三种指标均符合公式(1)(2)的条件。总的来说,标准沸点的测试集预测统计整体是很好的。

◇ 应用域介绍:

对于一个可靠的QSAR预测结果而言除了关注模型预测能力外,还需确定目标化合物是否在该模型的应用域范围内。应用域的功能就是界定能够被QSAR模型可靠预测的化合物,也可理解为模型适用化合物的集合,通常可通过可从4方面来表征模型的应用域:


①描述符变化范围;②结构相似性;③机理相似性;④代谢转化途径和产物,


若目标化合物的上述特征在QSAR模型的应用域内,则预测结果具有良好的可靠性;反之,则预测结果不具备良好的可靠性。


3-氯-2-甲基苯胺(CAS:87-60-5)的IGC50(T. pyriformis 48-hr)预测为例,如下图所示,3-氯-2-甲基苯胺均在层次聚类法建立的多个预测模型的应用域范围内,即Applicability Domain的一列结果均为“OK”,因此模型的总体预测结果相对可靠。


若目标化合物预测结果此列并非“OK”,而显示为“Rmax constraint not met”、“Model ellipsoid constraint not met”或是某个结构片段超出应用域范围,其预测结果须谨慎使用。

图片4.png

综上所述,T.E.S.T是一款由US EPA官方研究开发的QSAR毒性预测软件,可以根据化合物的结构信息预测其潜在毒性及理化性质,其中包括较为常见的7种毒性预测终点和9种理化性质预测终点,并且具有5种预测方法,预测能力较好,结果可信度较高,但在使用的过程中仍需要对目标物质和预测结果进行专家评估以得出专业准确的结论。


在使用方面,软件整体安装简单,操作便捷,用户界面友好,并且配有较为详细的用户指南。随着US EPA地不断更新与完善,目前TSET已经更新至5.1.2版本,适用于Windows和macOS系统。更详细的内容请参考软件指南User’s Guide for T. E. S. T. (Toxicity Estimation Software Tool) Version 5.1。

软件链接:Toxicity Estimation Software Tool (T.E.S.T) | US EPA

640 (5).png

T.E.S.T使用指南

 


参考文献:

[1] Honma M. An assessment of mutagenicity of chemical substances by (quantitative) structure-activity relationship. Genes Environ. 2020;42:23.

[2] De P, Kar S, Ambure P, et al. Prediction reliability of QSAR models: an overview of various validation tools. Arch Toxicol. 2022;96(5):1279-1295.

[3] U.S. EPA (2020). User’s Guide for T.E.S.T (version 5.1) (Toxicity Estimation Software Tool): A Program to Estimate Toxicity from Molecular Structure.

[4] 唐睿,张松林,粱云明,等. 毒性评估软件T.E.S.T及其在农业污染化合物QSAR研究中的应用[J]. 安徽农业科学,2010,38(36):20878-20879,20882

[5] US EPA. Environmental Optimization Using the Waste Reduction Algorithm. 2011 4/18/16]; Available from: nepis.epa.gov/Exe/ZyPURL.cgi?Dockey=P100DZKT.TXT.

[6] Martin TM, Harten P, Young DM, et al. Does rational selection of training and test sets improve the outcome of QSAR modeling?. J Chem Inf Model. 2012;52(10):2570-2578.

[7] 王中钰,陈景文,傅志强,等.QSAR模型应用域的表征方法[J].科学通报,2022,67(3):255-266.

[8] 陈景文,李雪花,于海瀛,王亚南,乔显亮.面向毒害有机物生态风险评价的(Q)SAR技术:进展与展望[J].中国科学(6期):461-474[2024-01-16]


相关阅读

【官宣】合律曼获任浙江省化工产业数据知识产权跨境流通创新联合体副秘书长单位

11月10日,浙江省知识产权研究与服务中心、杭州市知识产权局、拱墅区人民政府联合主办人工智能背景下涉外知识产权服务与合作主题交流活动。浙江省知识产权局副局长顾文海致辞拱墅区副区长沈建立致欢迎辞活动以“智创未来,护航出海”为主题,汇聚政府、服务机构、企业等多方力量,共同探索涉外知识产权服务新路径。在浙

2025-11-13 16:58:40阅读全文

【官宣】合律曼获任浙江省化工产业数据知识产权跨境流通创新联合体副秘书长单位

11月10日,浙江省知识产权研究与服务中心、杭州市知识产权局、拱墅区人民政府联合主办人工智能背景下涉外知识产权服务与合作主题交流活动。浙江省知识产权局副局长顾文海致辞拱墅区副区长沈建立致欢迎辞活动以“智创未来,护航出海”为主题,汇聚政府、服务机构、企业等多方力量,共同探索涉外知识产权服务新路径。在浙

2025-11-13 16:58:40阅读全文

【官宣】合律曼获任浙江省化工产业数据知识产权跨境流通创新联合体副秘书长单位

11月10日,浙江省知识产权研究与服务中心、杭州市知识产权局、拱墅区人民政府联合主办人工智能背景下涉外知识产权服务与合作主题交流活动。浙江省知识产权局副局长顾文海致辞拱墅区副区长沈建立致欢迎辞活动以“智创未来,护航出海”为主题,汇聚政府、服务机构、企业等多方力量,共同探索涉外知识产权服务新路径。在浙

2025-11-13 16:58:40阅读全文

【官宣】合律曼获任浙江省化工产业数据知识产权跨境流通创新联合体副秘书长单位

11月10日,浙江省知识产权研究与服务中心、杭州市知识产权局、拱墅区人民政府联合主办人工智能背景下涉外知识产权服务与合作主题交流活动。浙江省知识产权局副局长顾文海致辞拱墅区副区长沈建立致欢迎辞活动以“智创未来,护航出海”为主题,汇聚政府、服务机构、企业等多方力量,共同探索涉外知识产权服务新路径。在浙

2025-11-13 16:58:40阅读全文

欧盟REACH法规行政费将于11月5日正式上涨19.5%

2025年10月15日,欧盟委员会正式通过欧盟委员会实施条例(EU)2025/2067,对于欧盟《化学品的注册、评估、授权和限制法规》(REACH法规)下向欧洲化学品管理局(ECHA)支付的行政费进行调整,调整后的注册行政费上涨19.5%,SME企业(中、小、微型企业)注册行政费保持不变。本条例已于

2025-10-17 15:01:39阅读全文

喜讯!合律曼成功为国内大型聚合物生产企业完成乌克兰UA-REACH预注册

10月1日,合律曼受国内大型聚合物生产出口企业委托,成功完成乌克兰UA-REACH预注册,并获得乌克兰官方下发的预注册号,在欧洲进口分销商要求的预注册合规时间之前顺利完成,帮助国内企业顺利出口和保障对欧及对乌克兰市场供应链的持续稳定,得到国内外客户的认可。乌克兰UA-REACH针对聚合物的(预)注册

2025-10-10 15:03:04阅读全文

乌克兰UA REACH预注册2026年1月26日截止! 提前布局,抢占市场先机

关于UAREACH2024年7月23日,乌克兰政府批准了符合欧盟REACH标准的《化学产品安全技术法规》,即乌克兰REACH(又称UA-REACH)。该法规是乌克兰建立符合欧盟标准的化学产品国家管理体系的重要文件,其目的是保护人类健康和环境免受化学物质相关风险的影响,同时促进这些物质在市场上的自由流

2025-09-09 11:39:58阅读全文

QSAR在农药TE评估中的应用

关于农药TE评估在农药登记领域,QSAR主要用于原药等同性评估(TechnicalEquivalence),也即TE评估。TE评估主要是确定不同来源的原药在化学组成上的相似性。TE评估有两个重点:首先要满足如果新来源活性成分含量要不低于参考来源(既要保证农药的效果),接下来在满足上述条件的基础上,要

2025-07-27 14:52:15阅读全文

欧盟REACH:推荐包括三聚氰胺在内的四种物质加入授权清单

欧洲化学品管理局(ECHA)为保护健康和环境,建议欧盟委员会将包括三聚氰胺在内的四种物质列入REACH授权清单。一旦列入清单,企业若想继续使用这些物质,必须申请授权。企业若想在日落日期后继续使用授权清单中物质,需要提交授权申请,在最新申请日期前提交,并获得欧盟委员会的授权决议批准。最新申请日期和日落

2025-11-19 15:36:35阅读全文

英国UK REACH:授权物质清单拟新增3种生殖毒性物质

2025年11月4日,英国健康与安全执行局(HSE)发布公告,提议将三种具有生殖毒性的化学物质列入《化学品注册、评估、授权和限制法规》(UKREACH)授权清单(附件14)。这是英国脱欧后首次提议将物质列入授权清单。提案涉及物质这三种物质均被英国REACH第57(c)条归类为生殖毒性物质,并已列入欧

2025-11-18 17:33:00阅读全文

美国TSCA:更新三氯乙烯(TCE)的风险管理规则状态

美国环境保护署(EPA)将三氯乙烯(TCE)最终风险管理规则中《有毒物质控制法》(TSCA)第6(g)条豁免要求的生效日期进一步推迟至2026年2月。这将确保EPA的行政中止时间与法院采取此行动的时间安排保持一致。2024年12月17日EPA发布了最终规定,全面禁止TCE的使用,其中大部分禁令于20

2025-11-17 17:00:00阅读全文

行业干货:货物运输条件鉴定与危险特性分类鉴别的区别分析

在全球化贸易与现代化物流高速发展的今天,确保货物尤其是化工品,在生产加工、运输、下游使用等环节中的安全,是维护人民生命财产安全、保护生态环境以及保障供应链顺畅的基石。为了实现这一目标,如何对产品(货物)进行危险性鉴定以及对运输条件的鉴定,变得尤为重要。货物运输条件鉴定与危险特性分类鉴别对于化工从业者

2025-11-14 17:07:01阅读全文

推荐服务

0571-8606 0701

联系方式

地址:浙江省杭州市拱墅区储鑫路21号网谷创新中心8幢903室

邮箱:info@compliancemen.com

QQ:3671987934

微信咨询

微信公众号

2012-2025 杭州合律曼数据服务有限公司版权所有 All Right Reserved 浙ICP备2025192110号-1